这一切似乎都呈现出一番欣欣向荣的景象，然而直到高祖二十一年发生了变化，远离京城的丰州发生了一次大规模的抗税纳捐的事件，税吏被杀死，县府知县、县尉被愤怒的乡民活埋，最后愈演愈烈，逐渐转变为一次起义事件，朝廷最终派重兵镇压，带头的一众乡民被押至长安斩首示众，其余从众被就地格杀，至此其余各地发生的抗税纳捐事件也逐渐偃旗息鼓。在当日押赴刑场之前，在一番审问之后，高祖一夜未眠，随后招宰相及六部主官于太和殿议事三日之后，开始推行两税法，取消其他各捐杂税，同时在各部州设立刺史，建立健全中央对地方的监察体系，并以“奉诏六条察州”之规定，整饬吏治，维护皇权，促进社会经济发展。
两税法，即取消租庸调及各项杂税、杂役，只保留户税和地税；其次“量出制入”，由中央预算开支已确定赋税总额，并根据太祖十四年征收标准分摊于各地、各州，进行征收赋税。其中户税是按户等高低征钱，户等高的出钱多，户等低的出钱少。户等划分，是依据财产的多寡，户税在征收时大部分钱要折算成绢帛，征钱只是很少一部分；再次地税按亩征收谷物，纳税的土地以太祖十四年的垦田数为准；再次无论户税和地税，都分夏秋两季征收，夏税限六月纳毕， 秋税限十一月纳毕。因为夏秋两征，因此称为两税法，其夏税主要有丝、绵、丝织品、大小麦、钱币等，秋税征收稻、粟、豆类、草等；最后，没有固定住所的商人所在州县依据其收入征三十分之一的税。此时，两税法的实施，把征税原则由按人丁转为按贫富，在一定程度上减轻了农民负担，缓解了社会矛盾。至此高宗十二年，两税法已实施近二十年，朝堂虽有几次