第20章基因(1/3)

    这个问题远没有这么简单。基因组学发展到今天，围绕它的讨论和争议，从结构和功能基因组学，到生命进化，一直到哲学，甚至到学术资源政治版图的划分，可以写上一个很有趣的故事。

    存在即合理。

    这个没错。

    但是，存在即有用吗？譬如我们的阑尾和智齿，它们用处不大，麻烦不小，更多地是人类进化过程中留下的遗迹，绝非什么宝贝。

    人类基因组中的非编码序列，也要辩证地来看。

    早在20世纪六七十年代，人们就开始把非编码序列称为“垃圾dna”了。

    然而人们很快就发现，不少非编码序列跟基因的转录调控密切相关。

    垃圾并不垃圾，生命也绝非仅有中心法则。

    那么非编码序列中都有些什么好东西呢？教科书中经典的非编码dna元件，如启动子和增强子，可动遗传因子，还有具有生物活性的小rna。

    分子生物学发展的早期，科学家为了窥破生命这一黑箱，所设计的精妙绝伦的生物化学实验，实在令后生拍案叫绝！

    而在这高通量、大数据为王的新世纪，非编码dna研究的主力毫无疑问是ende计划。

    这是全球大规模合作的科研项目的典范，生物大数据的先驱。

    全球数十个科研团队，用最新开发的高通量实验方法，系统地，全面地扫描人类和其他生物各种组织中所有非编码dna的生物活性。

    他们用的方法有chip-seq（检测染色质和蛋白质的相互作用），rna-seq（把细胞里的所有rna分子作为一个整体测序），dnase-seq（把染色质上对dna酶敏感的区域，也就是结构较疏松较暴露的区域给测序），等等等等。

    可惜当时还没有crispr，否则检测基因组区域的功能（不管编码非编码）是非常地合适（veretal，2017）。

    现在人们已经开始跟进了。

    2012年，ende的研究成果集中喷发。

    《科学》杂志社的评论家elizabethpennisi总结道：“本周有三十篇论文在《自然》、《科学》等期刊上发表，宣告了垃圾dn